प्रधानमंत्री नरेंद्र मोदी के नेतृत्व वाली भारत सरकार ने जांच आयोग अधिनियम, 1952 के तहत एक जांच आयोग अधिसूचित किया है, जिसकी अध्यक्षता गौहाटी उच्च न्यायालय के पूर्व मुख्य न्यायाधीश न्यायमूर्ति अजय लांबा, हिमांशु शेखर दास, आईएएस (सेवानिवृत्त) और आलोक के साथ करेंगे। प्रभाकर, आईपीएस (सेवानिवृत्त) मणिपुर राज्य में 03.05.2023 और उसके बाद हुई हिंसा की घटनाओं की जांच के लिए सदस्य के रूप में।
आयोग मणिपुर में हुई हिंसा के कारणों और प्रसार के संबंध में जांच करेगा, और क्या किसी जिम्मेदार अधिकारियों या व्यक्तियों की ओर से कोई चूक हुई थी। केंद्रीय गृह मंत्री और सहकारिता मंत्री, अमित शाह ने 29 मई 2023 से 1 जून 2023 के दौरान मणिपुर राज्य का दौरा किया था और स्थिति का जायजा लेने के बाद जांच आयोग की नियुक्ति की घोषणा की थी।आयोग जितनी जल्दी हो सके केंद्र सरकार को अपनी रिपोर्ट प्रस्तुत करेगा, लेकिन इसकी पहली बैठक की तारीख से छह महीने के बाद नहीं। आयोग का मुख्यालय इंफाल में होगा।